Calibrating optical tweezers with Bayesian inference

Maximilian Richly 1 Silvan Türkcan 1 Antoine Le Gall 2 Nicolas Fiszman 2 Jean-Baptiste Masson 3 Nathalie Westbrook 2 Karen Perronet 2 Antigoni Alexandrou 1, *
* Auteur correspondant
1 LOB - Laboratoire d'optique et biosciences
2 Laboratoire Charles Fabry / Biophotonique
LCF - Laboratoire Charles Fabry
3 Physique des Systèmes biologiques
Abstract : We present a new method for calibrating an optical-tweezer setup that does not depend on input parameters and is less affected by systematic errors like drift of the setup. It is based on an inference approach that uses Bayesian probability to infer the diffusion coefficient and the potential felt by a bead trapped in an optical or magnetic trap. It exploits a much larger amount of the information stored in the recorded bead trajectory than standard calibration approaches. We demonstrate that this method outperforms the equipartition method and the power-spectrum method in input information required (bead radius and trajectory length) and in output accuracy.
Type de document :
Article dans une revue
Optics Express, Optical Society of America, 2013, 21 (25), pp.31578. 〈10.1364/OE.21.031578〉
Liste complète des métadonnées

Littérature citée [23 références]  Voir  Masquer  Télécharger
https://hal-iogs.archives-ouvertes.fr/hal-00918884
Contributeur : Karen Perronet <>
Soumis le : lundi 16 décembre 2013 - 08:24:09
Dernière modification le : jeudi 7 février 2019 - 16:30:12

Fichier

Richly2013OpEx.pdf
Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte

Identifiants

Collections

PASTEUR | X-LOB | X | IOGS | PARISTECH | LCF_BIOPHOTONIQUE | LCFIO | X-DEP-BIO

Citation

Maximilian Richly, Silvan Türkcan, Antoine Le Gall, Nicolas Fiszman, Jean-Baptiste Masson, et al.. Calibrating optical tweezers with Bayesian inference. Optics Express, Optical Society of America, 2013, 21 (25), pp.31578. 〈10.1364/OE.21.031578〉. 〈hal-00918884〉

Exporter

BibTeX TEI DC DCterms EndNote

Partager

Métriques

Consultations de la notice

765

Téléchargements de fichiers

340

Contact

support.ccsd.cnrs.fr
hal.support@ccsd.cnrs.fr
Logo CCSD