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L’unité mixte de recherche Écologie et santé des écosystèmes (UMR ESE) a été créée le 1erjanvier 2008 à partir du regroupement de scientifiques de :

• l’Institut national de la recherche agronomique (INRA), département Écologie des forêts, des prairies et des milieux aquatiques et centre de Rennes
• l’Institut supérieur des sciences agronomiques, agroalimentaires, horticoles et du paysage (Agrocampus Ouest), centre de Rennes

L’unité se situe à Rennes (Bretagne) et conduit des recherches principalement sur les écosystèmes aquatiques et leurs transformations dans le contexte d’anthropisation et de changement global.

 Trois équipes de recherche composées de scientifiques et de techniciens développent des projets communs.

• L’équipe Conservation et restauration des écosystèmes aquatiques travaille sur les populations de poissons d’eau douce et développe des méthodes pour la gestion de leurs écosystèmes.
• L’équipe Écologie halieutique étudie l’évolution des écosystèmes marins et leurs ressources biologiques.
• L’équipe Écologie évolutive des perturbations liées aux invasions biologiques et aux xénobiotiques étudie les mécanismes d'installation des espèces animales et végétales allochtones et les impacts sur les écosystèmes. 
  Cette nouvelle équipe est le résultat de la fusion des anciennes équipes Écologie des invasions biologiques (EIB) et Écotoxicologie et qualité des milieux aquatiques (EQMA).

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